簡単・低価格の革新的な創薬ツール 「MolSpace」で世界に挑む ～レベルファイブ～

直感的な操作で新しい創薬の時代に
株式会社レベルファイブは2004年に設立されたシステムインテグレータ（SIer）で、ソフトウェアの開発やインフラ・ネットワークの構築などを手がけている。近年は製薬会社の創薬に携わる中で、同社もITを通じた創薬研究に進出している。
「弊社では、HP Z840にMolDeskを搭載したパッケージ製品、MolSpaceを発表します。これはユーザが手ごろに購入して、マニュアルいらずで、30分以内にすぐおぼえられ使用可能な創薬のためのオールインワンソリューションです（図1）」とレベルファイブのインフラストラクチャー事業部長の太田氏。
myPrestoは経済産業省及びNEDOから委託を受けて一般社団法人バイオ産業情報化コンソーシアム（JBIC）が研究開発した医薬品開発支援の分子シミュレーションシステムで、ソフトウェアは大阪大学蛋白質研究所付属プロテオミクス総合研究センターのウェブサイトから入手できる。しかし文字入力で動かすCUI（キャラクタユーザインタフェース）なので、操作法取得には時間が必要だ。
myPrestoをGUI（グラフィカルユーザインタフェース）で扱いやすい製品にしたのが、情報数理バイオが開発したMolDeskであり、それをGPUを実装したZ840に搭載したのがMolSpaceとなる。（図2）。
myPresto開発の中心メンバーである国立研究開発法人産業技術総合研究所の福西氏は「創薬という分野において、計算から実験に至るまでコンピュータ上で全部できてしまう、そういうシステムを作りたいと思っていました。モノ作りの世界では、旋盤や工場がなくてもコンピュータ上で図面を描けば、3Dプリンタで立体物が作成できる時代です。生物の分野では積極的ではありませんが、同様に変化していくはずだ、と思い実際に実験してみました。そしてコンピュータ上で設計し、それを発注して合成し、実験して結果を出すところまで全部外注で行なう、というのを可能にした。つまり、実際の生物を使用した環境を持っている人でなければ実験ができない、という時代は終わりで、合成化学の知識がなくても物質を作成できるのです」とmyPrestoの意義を語る。
しかし福西氏の希望は、ただのプログラムではなく、グラフィックで使いやすいシステムに組みたい、というものだった。その提案に手を挙げ、製品化にこぎつけたのが情報数理バイオとレベルファイブだった。両者のタッグにより、これまでにないプロジェクトが現実のものとなってきた。